Οι Εργαστηριακοί Χώροι του Τμήματος, διαθέτουν επαρκείς εγκαταστάσεις και άριστες υποδομές και εξοπλισμό για τη διεξαγωγή των εργαστηριακών μαθημάτων και των ασκήσεων πράξης, για την εκπόνηση πτυχιακών εργασιών και πρακτικής
άσκησης και ιδιαίτερα για την ερευνητική δραστηριότητα.
Το τμήμα διαθέτει τα παρακάτω εργαστήρια:
“Εργαστήριο Αξιοποίησης Γεωργικών Υπολειμμάτων“
“Εργαστήριο Γεωργικής Γενετικής και Βελτίωσης Φυτών“
“Εργαστήριο Γεωργικών και Θερμοκηπιακών Κατασκευών“
“Εργαστήριο Γεωργικής Φυσικοχημείας“
“Εργαστήριο Γεωργικής Υδραυλικής“
“Εργαστήριο Μηχανικής των Ρευστών“
“Εργαστήριο Δενδροκομίας“
“Εργαστήριο Εδαφολογίας“
“Εργαστήριο Φυτοπροστασίας“
“Εργαστήριο Φυσιολογίας και Βιοχημείας Φυτών“
“Εργαστήριο Φυσιολογίας και Θρέψης Φυτών“
“Εργαστήριο Χημείας Υδάτινου Περιβάλλοντος“
“Εργαστήριο Μελισσοκομίας“
Διαθέτει τρία μικρά ερευνητικά σύγχρονα θερμοκήπια του εργαστηρίου Γεωργικών και Θερμοκηπιακών Κατασκευών, με Μετεωρολογικό Σταθμό και το Θερμοκήπιο – Αεροπονική Φάρμα του εργαστηρίου Φυσιολογίας και Θρέψης Φυτών.
Το τμήμα διαθέτει επίσης δύο μεγάλα σύγχρονα θερμοκήπια: το Θερμοκήπιο Λαχανοκομίας και το Θερμοκήπιο Ανθοκομίας .
Έχει προγραμματισθεί η κατασκευή ενός ακόμη θερμοκηπίου ειδικών προδιαγραφών για τις ανάγκες του εργαστηρίου Φυτοπροστασίας.